1、貫徹執行出入境衛生檢疫、動植物檢疫和進出口商品檢驗法律、法規和政策規定的實施細則、辦法及工作規程，負責所轄區域的出入境檢驗檢疫、鑒定、認證和監督管理等行政執法工作。

2、負責實施出入境衛生檢疫、傳染病監測和衛生監督，負責口岸傳染病的預防與控制工作，負責出入境人員的預防接種和傳染病監測體檢的管理工作

3、負責實施出入境動植物及其產品和其他檢疫物的檢驗檢疫與監督管理，負責動植物疫情監測、調查等工作，辦理國家出入境檢驗檢疫局授權的動植物檢疫審批，實施動植物疫情的緊急預防措施。

4、負責實施進出口商品（含食品）的法定檢驗和監督管理，負責實施一般包裝和出口危險品貨物包裝檢驗，負責進出口商品鑒定管理工作，負責實施外商投資財產鑒定，辦理進出口商品復驗工作

5、負責實施對進出口食品、動植物及其產品等的生產（養殖、種植）、加工和存放等單位的衛生、檢疫注冊，負責實施進口安全質量許可和出口質量許可工作，負責實施進出口產品、體系認證和實驗室認可、人員注冊等工作，并監督管理。

6、負責實施國家實行進口許可制度的民用商品的入境驗證，負責出口、轉口商品的有關出境驗證

7、負責實施出入境交通運載工具和集裝箱及容器的衛生監督、檢疫監督和有關的適載檢驗、鑒定，負責出入境交通運載工具、集裝箱、包裝物及鋪墊材料和貨物的衛生除害處理的管理工作